Η κολονοσκόπηση αποτελεί βασικό εργαλείο πρόληψης και έγκαιρης διάγνωσης παθήσεων του παχέος εντέρου, συμπεριλαμβανομένου του καρκίνου.

Η γαστροσκόπηση επιτρέπει την άμεση αξιολόγηση του οισοφάγου, του στομάχου και του δωδεκαδακτύλου για τη διάγνωση φλεγμονών, ελκών και άλλων παθήσεων.

Η ERCP (Ενδοσκοπική Παλίνδρομη Χολαγγειοπαγκρεατογραφία) χρησιμοποιείται για τη διάγνωση και θεραπεία παθήσεων των χοληφόρων και του παγκρέατος, όπως λιθίαση, στενώσεις και κακοήθειες.

Η ενδοσκοπική γαστροστομία αποτελεί ασφαλή μέθοδο μακροχρόνιας σίτισης σε ασθενείς που δεν μπορούν να σιτιστούν από το στόμα.

Ο ενδοσκοπικός υπέρηχος συνδυάζει ενδοσκόπηση και υπερηχογραφία, προσφέροντας υψηλή διαγνωστική ακρίβεια σε παθήσεις παγκρέατος, χοληφόρων και υποβλεννογόνιων βλαβών.

Η Βαριατρική Ενδοσκόπηση (π.χ. ενδοσκοπική γαστροπλαστική) αποτελεί μια ενδεδειγμένη και προτεινόμενη μέθοδο για την αντιμετώπιση της παχυσαρκίας.